MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 2886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	AT	3	6	1312	1317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017096	TAAT	2	8	1521	1528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017096	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017096	CCGAAG	2	12	4313	4324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017096	G	6	6	4346	4351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017096	TTC	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017096	CTA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017096	T	6	6	5108	5113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017096	A	6	6	5114	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017096	TACT	2	8	5204	5211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017096	CCT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017096	TAT	2	6	6556	6561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017096	A	6	6	6620	6625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017096	TGG	2	6	13396	13401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017096	CTC	2	6	13446	13451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017096	TCATT	2	10	13453	13462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017096	TCC	2	6	13513	13518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017096	T	6	6	13578	13583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017096	GGA	2	6	13601	13606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017096	CTC	2	6	13615	13620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017096	TTCG	2	8	13643	13650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017096	CGT	2	6	13656	13661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017096	AG	3	6	13712	13717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017096	AGG	2	6	13753	13758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017096	CAAT	2	8	14540	14547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017096	A	6	6	14557	14562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017096	AGG	2	6	14588	14593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017096	TTC	2	6	14602	14607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017096	CTT	2	6	14672	14677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017096	TTCG	2	8	14741	14748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017096	T	7	7	14756	14762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017096	G	6	6	14763	14768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017096	G	6	6	14777	14782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017096	TTCG	2	8	14823	14830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017096	TCC	2	6	14878	14883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017096	TG	3	6	14965	14970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017096	T	7	7	14999	15005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017096	TG	3	6	15008	15013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017096	T	7	7	15347	15353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017096	TGG	2	6	15378	15383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017096	TTA	2	6	17452	17457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017096	ATCTGA	2	12	17463	17474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017096	TA	3	6	17501	17506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017096	CAA	2	6	17606	17611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017096	AT	3	6	17657	17662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017096	A	7	7	17678	17684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017096	A	6	6	18321	18326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017096	ATT	2	6	18356	18361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017096	CCT	2	6	18885	18890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017096	TA	3	6	19042	19047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017096	ATT	2	6	19059	19064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017096	TTAC	2	8	19137	19144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017096	TA	3	6	19161	19166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017096	TG	3	6	21888	21893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017096	AAT	2	6	21895	21900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017096	AAT	2	6	21915	21920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017096	TTA	2	6	21961	21966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017096	TAT	2	6	21990	21995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017096	AGG	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017096	T	6	6	22046	22051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017096	ATT	2	6	22053	22058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017096	CAAA	2	8	22110	22117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017096	T	6	6	22992	22997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017096	GTA	3	9	23031	23039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017096	AAAAAT	2	12	23040	23051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017096	AGG	2	6	23059	23064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017096	AGGC	2	8	23626	23633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017096	TGCC	2	8	23639	23646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017096	T	6	6	23647	23652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017096	TAAA	2	8	23657	23664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017096	CCT	2	6	24549	24554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017096	AAT	2	6	24558	24563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017096	ATT	2	6	24577	24582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017096	ATTG	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017096	TAA	3	9	25571	25579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017096	TG	3	6	25598	25603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017096	GCCT	2	8	25650	25657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017096	AAG	2	6	25665	25670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017096	CTT	2	6	25685	25690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017096	T	7	7	25692	25698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017096	A	7	7	25699	25705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017096	AGG	2	6	25712	25717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017096	AGGG	2	8	27555	27562	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017096	TCCC	2	8	27567	27574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017096	ATT	2	6	27578	27583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017096	AGG	2	6	27584	27589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017096	TAT	2	6	28694	28699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017096	AAT	2	6	28700	28705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017096	ATTT	2	8	29697	29704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017096	AT	3	6	29716	29721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017096	CTAAA	2	10	29745	29754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017096	TTG	2	6	29779	29784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017096	T	7	7	29859	29865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017096	A	6	6	31243	31248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017096	CTTCGG	2	12	31478	31489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017096	GA	3	6	31558	31563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017096	AGG	2	6	31587	31592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017096	TAA	2	6	31708	31713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017096	AGG	2	6	31816	31821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017096	ATTT	2	8	34306	34313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017096	TGAA	2	8	34318	34325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017096	T	6	6	34382	34387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017096	CAA	2	6	36203	36208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017096	TA	3	6	36231	36236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017096	T	6	6	40737	40742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017096	T	6	6	40761	40766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017096	GT	3	6	40771	40776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017096	AAG	2	6	40801	40806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017096	AATT	2	8	40837	40844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017096	AAG	2	6	40853	40858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017096	GAG	2	6	40866	40871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017096	CATAAA	2	12	40921	40932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017096	A	6	6	40930	40935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017096	CGAA	2	8	40997	41004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017096	AGG	2	6	41066	41071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017096	TCGA	2	8	41084	41091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017096	CTC	2	6	41119	41124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017096	T	6	6	41153	41158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017096	CTTCGG	2	12	41218	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017096	ACC	2	6	41302	41307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017096	ATT	2	6	41333	41338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017096	TC	3	6	41374	41379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017096	AGT	2	6	41398	41403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017096	TC	3	6	41409	41414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017096	AGA	2	6	41473	41478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017096	A	8	8	41478	41485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017096	AAG	2	6	41537	41542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017096	CAG	3	9	41618	41626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017096	ATG	2	6	41627	41632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017096	GAA	2	6	41663	41668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017096	AGA	2	6	41699	41704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017096	CT	3	6	41713	41718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017096	AGA	2	6	41848	41853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017096	GGA	2	6	41947	41952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017096	TAC	2	6	41975	41980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017096	TAAA	2	8	42117	42124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017096	TGT	2	6	42127	42132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017096	AGG	2	6	42153	42158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017096	A	6	6	43850	43855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017096	ATA	2	6	43934	43939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017096	CAG	2	6	43948	43953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017096	AAT	2	6	43954	43959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017096	AGT	2	6	43972	43977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017096	A	6	6	44025	44030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017096	TCC	2	6	44077	44082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017096	G	6	6	44248	44253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017096	AGG	2	6	44288	44293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017096	TC	3	6	44299	44304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017096	GGA	2	6	44327	44332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_017096	TAA	2	6	94948	94953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017096	ATT	2	6	94971	94976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017096	TAT	2	6	95906	95911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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